Guide rapide - Tests ADN Y chez FTDNA

Le chromosome Y n'existe que chez l'homme et est transmis de père en fils. Ce type de test ADN n'est donc disponible que chez les hommes.

Types de tests Y

Le chromosome Y peut être analysé de deux façons différentes : par STR ou par SNP.

Le test STR consiste à compter le nombre d'occurences d'un certain motif dans une section du chromosome Y. Pour utiliser ces résultats, il n'est pas nécessaire de savoir à quoi tel marqueur STR correspond. FTDNA va rechercher parmi tous les autres résultats Y lesquels sont les plus près du vôtre.

Le test SNP est très différent. Il s'agit de détecter si une mutation précise a eu lieu ou non. Si vous l'avez, le résultat est positif. Le test de base de FTDNA prédit le résultat SNP à partir des marqueurs STR. Dans quelques cas, la prédiction est erronée. Sinon, cela donne une mutation assez ancienne. Par exemple, R-M269, le SNP le plus fréquent dans l'ouest de la France et au Québec, serait apparu il y a environ 13000 ans.

Ces informations forment la signature ADN Y recherchée.

Triangulation

Une triangulation consiste à trouver 2 descendants en ligne masculine du même homme (ACPR ou Ancêtre commun le plus rapproché, en anglais MRCA pour Most Recent Common Ancestor) ayant une signature ADN Y cohérente. Les signatures fusionnées sont considérées comme étant celle de l'ancêtre en question. Le but du test ADN Y est en partie d'identifier ces signatures et ancêtres.

Les signatures peuvent présenter une petite variation. Dans les tableaux de résultats de FTDNA, on verra des résultats différents pour chaque test. Dans le catalogue de signatures triangulées, on trouvera plutôt un amalgame des signatures des participants. Par exemple, si le 3e marqueur est 14 dans un résultat et 15 dans un autre, on affichera 14/15. En comparant un grand nombre de résultats, on peut distinguer la signature de l'ancêtre par rapport aux variations trouvées chez certains descendants. Toutefois, pour le moment, le catalogue montrera un amalgame sans mettre en valeur la signature initiale.

Idéalement, si le pionnier a au moins 2 fils ayant une descendance masculine, la triangulation est faite à partir de ces 2 fils. S'il en a 3, l'idéal englobera les 3 fils. Cela donnera une triangulation optimale. Si un seul fils a de la descendance ou si tous les tests viennent de descendants de ce fils, alors nous aurons une triangulation [-1]. De même, une [-2] concernera les descendants d'un petit-fils du pionnier.

Il est préférable d'être le plus près du pionnier, mais cela n'est pas toujours possible. Le nombre de descendants n'est pas distribué uniformément et il est donc plus difficile de trouver des candidats pour certaines branches. De plus, certains pionniers ont un seul fils ou un seul petit-fils avec de la descendance masculine. Dans certains cas, heureusement rares mais possibles, il n'est pas possible, pour le moment, d'identifier la signature de l'ancêtre parce qu'il y a 2 triangulations touchant ses fils ou petits-fils. En d'autres mots, la femme d'un des fils ou petits-fils a eu un enfant hors-mariage. À la longue, la fautive sera identifiée, mais pour le moment, une telle situation est déjà arrivée et pourrait survenir de nouveau. En optimisant une triangulation (en testant le descendant masculin d'un autre fils du pionnier), on identifie sa signature de référence de façon plus solide.

Si le pionnier est venu avec un frère et que des descendants des deux frères ont été testés, ce sera une triangulation [+1] (ou meilleure qu'optimale). Dans le cas rare où il s'agit de cousins, ce sera [+2].

Le calcul pour afficher [-1] ou [-2] est automatisé, mais pas pour les [+1] ou [+2]. Il se peut que certaines valeurs soient modifiées pour donner une meilleure idée de la qualité de la triangulation.

Les tests ADN Y chez FTDNA

FTDNA propose 2 séries de tests ADN Y. Il faut d'abord faire une analyse d'un certain nombre de marqueurs STR, soit de 12, 25, 37, 67 ou 111 marqueurs. À partir de ces résultats, le tableau comparatif des résultats affichera les valeurs trouvées et proposera un SNP. Voir par exemple les résultats du projet French Heritage.

Ces résultats sont groupés d'après le pionnier. Sur chaque ligne de résultats, on trouve le numéro du test, le nom de l'ancêtre le plus loin proposé par la personne testée, le pays d'origine, un SNP, puis les marqueurs STR. Le SNP est en rouge s'il est prédit à partir des marqueurs STR, et en vert si une analyse de marqueurs SNP a été faite.

La deuxième série de tests peut se faire de plusieurs façons. Un SNP précis, un groupe de SNP (SNP Packs) ou encore la plupart des mutations Y connues (Big Y).

Analyse des résultats - Correspondances (Matches)

À partir de votre profil, la section Y-DNA montre les sections suivantes : Matches, Ancestral Origins, Haplotree & SNPs, Matches Maps, Migration Maps, SNP Map, Haplogroup Origins, Y-STR Results, Print Certificates, Download SNP, Advanced Matches et Learn More.

La section Matches montre vos correspondances, soit les résultats les plus près des vôtres.

Ces résultats sont calculés par série, selon les tests commandés, en commençant par le plus complet. Si vous avez commandé un Y-111, vous verrez d'abord les résultats de ce test. Le haut de l'écran permet de filtrer ces résultats. On peut d'abord choisir où sont les résultats à comparer, soit à partir de toutes les données de FTDNA (The Entire Database), ou d'un projet précis. Il faut faire partie de ce projet pour voir les résultats.

Le filtre suivant choisi le nombre de marqueurs. Avec 37, par exemple, la comparaison se fait avec seulement les résultats à 37, 67 et 111 marqueurs des autres hommes testés. La distance génétique (DG, GD ou Genetic Distance) est le nombre de différences entre vos résultats et ceux du correspondant. Il ne s'agit pas du nombre de générations. L'ancêtre commun pourrait même se trouver à 5000 ans de distance et des centaines de générations. Cette distance forme la première colonne ainsi que le 3e filtre à votre disposition. Les distances permises dépendent du nombre de marqueurs.

• 12 (0-1). En d'autres mots, la comparaison à 12 marqueurs montrera d'abord les participants avec 12 marqueurs identiques (distance de 0), puis ceux avec une seule différence (distance de 1).
  
• Dans ce cas, et seulement dans ce cas (DG = 1, 12 marqueurs), vous ne verrez des résultats que si vous êtes dans un projet commun. En d'autres mots, vous verrez les DG=0 pour tout le site, mais les DG=1 si un projet est partagé. Il est donc utile de rejoindre plusieurs projets. Toutefois, si vous êtes dans le projet "Adoptés", vous verrez aussi les résultats avec DG=1 des autres projets.
  
• 25 (0-2). Avec 25 marqueurs ou plus, la recherche se fait parmi tous les résultats. Même si dans la version courante, vous pouvez choisir un nombre plus élevé, vous ne verrez que des résultats dont DG est parmi les valeurs au début des lignes de cette section. Les tests 12 et 25 ne sont disponibles qu'en les commandant par un projet. Ils ne sont pas affichés parmi les offres depuis la page d'accueil de FTDNA.
  
• 37 (0-4). Ceci est la valeur suggérée pour un test Y.
  
• 67 (0-7)
• 111 (0-10). Ceci est la plus grande valeur disponible pour ce type de comparaison, même si vous avez fait un test Big Y-500 ou Big Y-700 qui ajoute 500 ou 700 marqueurs STR.
  

D'autres filtres permettent de choisir le nombre de résultats par page, de filtrer selon le nom de la personne testée (qui n'est pas toujours celui du pionnier), ainsi que la période couverte par les tests (en anglais, donc mois/jour/année).

En partant de la gauche, les colonnes de résultats contiennent :

• La distance génétique avec la correspondance. Il est permis de choisir seulement une distance précise ou de voir tous les résultats, ainsi que de trier par cette colonne (valeur par défaut).
• Le nom du correspondant, ainsi que d'autres données.
  
• En cliquant sur le nom, vous verrez parfois des notes fournies par le testé. En examinant le nom, vous pourriez découvrir une parenté possible. Tenez compte toutefois de ces informations:
• Ce n'est pas tout le monde qui a été testé. En juin 2019, on trouve les signatures confirmées (par triangulation) de 220 pionniers (parfois, le père et le fils ou deux frères), et 418 signatures potentielles, sur une possibilité d'environ 3000 pour la Nouvelle-France. Les plus grosses familles sont triangulées. Il manque un grand nombre de signatures. Dans certains cas, c'est quand un participant à un projet est testé qu'on peut découvrir un 2e résultat puis confirmer une nouvelle signature.
• Parfois, le nom de famille est celui de la mère ou de son second conjoint, éventuellement quelques générations plus loin. Il est utile de cliquer sur le nom du correspondant et d'examiner son arbre en ligne s'il est disponible.
• Certains familles ont un surnom. Ainsi, l'ancêtre de la plupart des Beauregard du Québec s'appelle André Jarret. En France, la famille a conservé ce nom. En Amérique du Nord, on retrouve des Beauregard, Jarret, Jarais, Sharay et Vincent.
• Certains noms de famille se sont anglicisés (ou plutôt. adoptés à un nouvel environnement). Des Archambault sont devenus des Shambo, des Boisvert s'appellent maintenant Greenwood, etc.
  
• Le premier lien permet d'envoyer un courriel (email).
• Le lien TiP est une évaluation du nombre de générations en fonction des marqueurs différents. Vous aurez alors des statistiques comme : à 4 générations, les chances d'un ancêtre commun sont de 85%. Cela signifie que dans 85% des cas similaires, il y a un ancêtre commun à 4 générations. Certains suggèrent d'utiliser 50% pour identifier les cousins intéressants.
• Le carré avec un crayon sert à ajouter une note qui sera visible par vous-même et les administrateurs de vos projets. Elle pourrait dire, par exemple, que vous avez envoyé un courriel à telle date.
• Un carré bleu foncé avec le dessin d'un arbre indique la présence d'une généalogie en ligne. Parfois, il n'y a que le nom de la personne en question ou même que des données privées.
• Le champ suivant indique le test fait par le correspondant. Un FF signifie qu'un test Family Finder est aussi disponible. En théorie, vous devriez donc voir ce correspondant parmi vos résultats FF, si vous avez fait un tel test, et si le cousinage n'est pas trop éloigné.
• La colonne Earliest Known Ancestor montre le nom de l'ancêtre le plus éloigné en ligne paternelle. FTDNA recommande d'indiquer le nom du plus lointain, soit le père du pionnier en ce qui concerne le Québec ou l'Acadie (ou tout endroit en dehors de la métropole d'origine). Je recommande plutôt le nom du pionnier, de son conjoint et l'année de leur mariage. Avec seulement le père du pionnier, on aura sans doute une date de naissance et de décès estimée, souvent loin de la réalité, ce qui rendra difficile le groupement dans un projet.
• L'haplogroupe est une sorte de groupement selon l'ADN. Voir plus loin. Il est suivi du SNP terminal (ou apical, dans le sens de bourgeon) si un test de SNP a été réalisé.
• La dernière colonne indique la date où le correspondant a été découvert parmi les données. En triant par cette colonne, on pourra découvrir les plus récents.
  

Affichage des résultats des projets French Heritage et Acadian Heritage

Ces résultats sont groupés d'après le pionnier, une année de mariage réelle ou approximative, le nom du conjoint, ainsi qu'un lien vers la fiche GFAN et vers la triangulation le cas échéant. Chaque participant choisit d'afficher ou non ses résultats dans l'écran public. Il s'en suit que le nombre de données disponibles au visiteur n'est qu'une partie des données disponibles à l'interne.

Un code de couleurs est utilisé.

• Doré - si la signature est triangulée; celle-ci est alors identifiée avec un lien vers les lignées de référence.
  
• Rose (en cours de normalisation) ou gris (périmé) - si le couple ancestral est identifié, d'après les informations fournies par le testé ou le nom de famille s'il est rare.
• Turquoise - si la documentation n'est pas suffisante pour identifier le couple ancestral ou s'il y a une brisure génétique (par rapport à une triangulation). Certains groupes temporaires ont été créés pour réduire la quantité de non-groupés.
  
• ZyR Not documented [R-] regroupe des résultats non documentés au moment de leur regroupement. Dans certains cas, la documentation est apparue plus tard.
  
• Vert olive - la personne est en dehors de la zone d'étude (la francophonie) selon ses informations.

En choisissant d'afficher 500 résultats par page, en juin 2019 sur French Heritage:

• Les non-groupés débutent à la page 3. Il y en a autour de 1500 (mais une partie seulement est affichée en public).
  
• Les groupes temporaires sont sur la page 4.
  
• Les groupes non-documentés comme ZyE, ZyR, etc. sont sur la page 5.
  
• Les observateurs débutent sur la page 5.
  

Affichage des résultats du projet Québec ADN Y

Ce projet est géré de façon indépendante mais les triangulations sont présentées dans le catalogue collectif de signatures ADN.

Ces résultats sont groupés d'après le pionnier, le nom de ses parents, et l'année approximative de sa naissance et son origine. Un autre code de couleurs est utilisé. Voir ce lien pour la description des couleurs et des abréviations. https://drive.google.com/file/d/1HojzmDP-EJ-_JXUPmIyiqyj0SNgCbrX8/view

Affichage des résultats des projets patronymiques de l'auteur

Jusqu'au milieu de 2018, le site World Families Network regroupait un grand nombre de projets familiaux. Puis, en mai 2018, une nouvelle directive européenne est entrée en vigueur au sujet de la confidentialité des  données sur Internet. Cela signifie en particulier qu'on ne peut pas associer qui a fait un test ADN avec ses résultats sans sa permission. Notez que le catalogue de signature cache les couples mariés depuis moins de 100 ans, ce qui assure une protection optimale des informations personnelles. Le site WFN ayant un grand nombre d'informations personnelles a réglé la situation en retirant une partie de ses informations. Il en a résultés l'abandon d'un grand nombre de projets qui se sont retrouvés sans administrateur. Denis Beauregard a accepté de gérer ces projets orphelins de façon assez uniforme, soit en créant des groupes de résultats en fonction des données généalogiques. Les noms des groupes sont similaires à ceux du projet French Heritage. Les couleurs sont aussi similaires. Les observateurs sont devenus ceux ayant un nom de famille qui n'est pas couvert directement par le projet. L'auteur a aussi un accès interne à d'autres projets, mais n'en fait pas le regroupement.

Les catalogues de signatures ADN Y

On trouve d'un côté des signatures validées parce que les descendants en ligne masculine de deux fils ont été testées. Il s'agit de triangulations. D'un autre côté, certaines lignées ont été validées, mais non confirmées par une seconde lignée et d'autres reposent sur le travail non-vérifié d'une personne dont l'ADN Y a été analysé. Ce sont des candidats.

La page suivante contient des signatures triangulées provenant surtout des projets French Heritage et Québec ADN Y : https://www.francogene.com/triangulation/y.php Les pages de chaque triangulation montrent les lignées de référence.

Cette page montre dans une première partie les signatures triangulées, et dans la seconde, des candidats : https://www.francogene.com/gfan/gfan/998/adny.htm Il s'agit ici d'une liste des signatures avec le nom des conjoints et le nombre estimé de descendants (y compris par les femmes). Cette liste est mise à jour moins souvent que la précédente.

Marqueurs STR et SNP

Le test d'entrée chez FTDNA est toujours basé sur les STR (12, 25, 37, 67 ou 111). Il peut être suivi d'un test SNP.

Un test STR consiste à compter sur une partie du chromosome Y le nombre d'occurences de tel motif. Vous n'avez pas besoin de savoir de quel motif il s'agit. Ce test est statistique. Il fournit des chiffres qui peuvent être utilisés pour retrouver des résultats similaires avec une bonne probabilité que l'ancêtre trouvé ne soit pas trop éloigné. Cela ne signifie pas que les résultats semblables soient ceux de votre proche parenté, mais que ceux de votre proche parenté par les hommes soit à votre portée. On considère par exemple qu'à 111 marqueurs, quelqu'un avec une distance de 2 a probablement un ancêtre masculin commun assez proche. Avec 37 et un même nom de famille, la probabilité est forte pour qu'il s'agisse d'un même pionnier, ou dans de rares cas, d'un pionnier du même nom et venu de la même région, la France commençant à adopter des noms de famille vers l'an 1200. FTDNA fournit en plus une base commune pour comparer ces résultats, ce qui en fait le meilleur outil pour une étude génétique familiale selon les lignées paternelles.

Le test SNP est un complément. Le test STR prédit la catégorie principale ou haplogroupe. Par exemple, la plupart des Français de l'ouest de la France sont R-M269, soit le groupe R ayant la mutation ou le SNP M269. Quand M269 couvre 80% de la population, il n'est pas très précis. Cette mutation est suivie d'autres mutations qui permettent de mieux cibler une famille. Selon le labo ou le test, la même famille pourra avoir plusieurs SNP, qui sont en fait des étapes au fil des siècles. Voici comme exemple mon propre, celui des Jarret dit Beauregard.

• Un test STR prédit que le SNP est R-M269.
• Un test SNP fait dans le cadre du programme Geno2 a trouvé R-L151. Un autre labo donne R-A431.
• FTDNA a suggéré des séries de tests (SNP Packs) qui permettent d'avancer de quelques pas. Le bloc M343 a trouvé DF27, alors que le bloc P312 nous amène à ZZ12_1. Le test Big Y, qui est beaucoup plus complet et plus coûteux, a trouvé par la suite Y7363 puis Y41710. Sur l'axe du temps, ces étapes sont: R-M269→L151→P312→DF27→ZZ12_1→A431→Y7363→Y41710. M343 est en général omis. Pour résumer et aussi faciliter la recherche de documentation, l'haplogroupe est résumé avec R1b-Y41710. R1b est souvent utilisé dans la documentation et Y41710 est la mutation connue la plus récente, apparue il y a environ 1000 ans.
  
• Le catalogue indique les valeurs intermédiaires pour aider ceux qui sont testés sur d'autres sites, mais on peut voir que la précision est alors moindre parce qu'il y a plus de familles partageant les mêmes informations. Ainsi, pour le moment, il n'y a que les Beauregard du Québec (et les Jarret du Dauphiné en France) à être des Y41710. Les Pagé et Tousignant sont aussi Y7363, ainsi qu'un groupe d'Arméniens. L'ancêtre commun aurait vécu quelque part entre les années 500 et 1000. Un descendant est devenu Jarret dans le Dauphiné, d'autres ont pris le nom de Pagé et Tousignant, et finalement, l'un d'eux aurait pris part aux Croisades pour faire souche en Arménie.
  

Haplogroupe et haplotype

Un haplogroupe est une famille de premier niveau. Le format typique est une lettre suivie d'une mutation, comme E-M35, I-M253 ou R-M269. La lettre est une catégorie, une sorte de grande famille. La mutation est, selon le cas, la mutation typique pour cette lettre, ou une mutation plus récente.

Une notation alternative utilise plutôt les mutations principales qui ont mené à l'haplogroupe. Cette notation est de moins en moins utilisée parce qu'elle est instable. FTDNA l'a remplacée en 2014. Quand on découvre que 2 mutations sont arrivées dans un ordre différent, cette notation doit être changée.

La notation utilisée dans le catalogue est un peu différente. Voici un exemple.

L'haplogroupe en résumé comprend le code utilisé sur certains sites comme référence. Comme il y a eu beaucoup de travaux depuis quelques années et que certaines populations ont été favorisées, certains haplogroupes se sont révélés assez gros pour qu'on les distingue. Ainsi, R comprend les catégories principales R1a concentré en Europe de l'Est et R1b en Europe de l'Ouest. I1 rayonne depuis le sud de la Scandinavie et I2 depuis l'ex-Yougoslavie. En écrivant R1b-Y41710, on voit que les informations de base sont celles de R1b et pas seulement R, qui est beaucoup plus étendu.

L'haplogroupe étendu montre souvent les principales étapes suivies par la lignée au fil des siècles, en reprenant surtout les étapes affichées par des labos faisant un test moins poussé que les STR.

L'haplotype comprend les valeurs plus détaillées données par les STR.

L'haplogroupe ne permet pas de prédire de quelle région de France est venu un pionnier, à moins qu'il soit assez récent et qu'une autre famille porte le même haplogroupe. Par exemple, les I-M253 viennent surtout de Normandie, mais certains sont du Périgord dans le Sud de la France, de l'Anjou dans l'Ouest ou de la Lorraine dans l'Est.

Les tests SNP Packs et Big Y

Le test Big Y évalue plus de 500 000 SNP dans le chromosome Y. Voici un aperçu de mon propre test (Big Y 500).

510 419 valeurs ont été évaluées. De ce nombre, 328491 sont nouvelles et 181928 ont déjà un nom ou une étiquette. 84148 n'ont pu être lues. Parmi les 426271 valeurs lues, 277 ont une valeur différente de la valeur de référence, celle qui devrait apparaître dans la majorité des résultats.

La section Block Tree affiche les mutations nommées par bloc, afin de voir où se situe ma famille parmi les autres personnes testées. On part de la mutation BY36464 et à 40 SNP ou mutations maximales. Un des blocs mène à 2 familles ayant 18 SNP en commun. Un autre bloc commence avec 6 SNP partagés par 9 familles, puis 8 autres SNP et 4 familles. À ce moment, le diagramme se divise en 2, avec d'un côté les 2 Arméniens avec qui je partage la mutation Y41710 et deux autres, et les Blondell d'Irlande et Pagé de France qui n'ont pas ces mutations. Suivent 9 autres mutations chez les Arméniens et 7 dans mon cas. FTDNA ne fait pas d'évaluation des années qui correspondent alors que yfull propose que la mutation Y41710 soit apparue il y a 1550 ans (entre 2100 et 650 ans certain à 95%) et que la mutation qui me sépare des Arméniens date de 1100 ans. En moyenne, notre ancêtre commun (nous sommes issus de 2 fils de cet ancêtre) aurait donc vécu entre les années 469 et 1019. Vu qu'il y a des descendants européens peu avant, on doit déduire, d'après les connaissances de l'histoire, que l'ancêtre de ces Arméniens est un Français ayant participé aux Croisades et qu'il a laissé une descendance en Terre Sainte. Ces années sont théoriques puisque les mutations apparaissent au hasard.

En faisant une analyse similaire entre les deux branches des Gagnon, on trouve 6 SNP entre l'ancêtre commun aux deux familles Gagnon. Avec une moyenne de 144 ans par mutation, l'ancêtre commun aurait vécu il y a 864 ans. Mais il y a aussi 2 tests faits pour un des pionniers Gagnon et 3 SNP séparent ces descendants. Cela situerait donc l'ancêtre commun un peu plus tard, vers l'an 1300 ou 1400. Il est malheureusement impossible d'être plus précis.

On voit toutefois l'intérêt de ce type de test. En comparant par exemple un De Billy ou un Sévigny avec un descendant français de ces familles, on pourrait évaluer la valeur des hypothèses émises sur ces familles au sujet des ancêtres proposés en France en l'absence de document sur leur origine. En particulier, on saurait s'il s'agit de la même famille.

À mesure que de nouveaux tests Big Y seront effectués, des relations anciennes pourront être établies entre les familles analysées.